zunächst einmal die frage - wenn sie denn erlaubt ist - warum, wenn du schon einen barrierefreien auftritt machst, brauchst du dann den alten noch?
für alles weitere setze ich mal voraus, dass das notwendig ist. normalerweise erstellst du ja ein layout und positionierst darin die container. ich würde neu einen etwas anderen ansatz wählen.
ein layout besteht nämlich im wesentlichen aus einer ausgabe vor und einer nach dem eigentlichen inhalt. du kannst nun also das layout von zwei modulen ausgeben lassen. nennen wir sei einmal header und footer. dann machst du ein layout, dass kein html mehr enthält, sondern nur noch container. und zwar zwei mehr als vorher (einer für den header am anfang und einen zweiten für den footer).
beide auftritte nutzen die gleiche contenido-installation und den gleichen mandanten. die module footer und header geben aber, je nach situation den kopf und fuss der barrierefreien oder eben der konventionellen seite aus.
je nach komplexität des auftritts werden natürlich möglicherweise nicht mehr nur ein footer und ein header benötigt, sondern noch weitere layoutmodule, die den code zwischen den modulen ausgeben. hier ist einfach die frage, wie komplex der auftritt vorher war und wie komplex er barrierefrei sein wird.
daneben gibt es noch einen weiteren ansatz. dieser geht etwas zulasten der performance, dürfte jedoch einfacher sein in der umsetzung.
du gibst vor und nach jedem container eine kommentarzeile aus, die auskunft über die modulausgabe macht. z.b. in etwa so:
und am ende
dann schaltest du die ausgabepufferung ein (ob_end_start()) und gibst den puffer am ende der front_content.php an die ausgabe (ob_end_flush()). ganz am ende im layout setzt du ein modul, dass den ausgabepuffer ausliest (ob_get_contents()), isolierst mit regex die modulausgaben und giesst dann das ganze in das barrierfreie layout. dieses modul greift dann natürlich nur ein, wenn eine barrierefreie ausgabe vorzunehmen ist.
daneben gibt es sicher noch 10 verschiedene andere varianten, wie man das machen könnte.
hilft dir das weiter?